Niels Ibsen var 3 ganger gift.
1. gang i 1637 med Martha Roaldsdatter, datter av presten Roald Svendsen* på Ytteråsen* og hustru Elen Hansdatter,
hvis sønn Anders Roaldsen Opdal var sokneprest til Oppdal tra1633, døde 4/5 1644 og ble i balsamert stand gravlagt under gulvet i
sakristiet. En store stenhelle, flott utført med hennes navn m.v. og innhugne keruber i samtlige fire hjørner, ble innfelt i gulvet over kisten.
Ved restaureringen i 1860-årene ble kisten flyttet ut og nedsatt til venstre for inngangen til sakristiet, hvor stenhellen i dag markerer graven.
Han ble 2. gang gift med Birgitte Herdal, som visstnok døde på barselseng et års tid etter bryllupet.
Hun var datter av sokneprest til Sveg i Härjedalen, Mogens Pedersen Herdalinus.
Tredje gang giftet han Elisabeth Nilsdatter Balg, datter av sokneprest Niels Pedersen Balg, Støren.
Av barn kjennes kun en datter, sannsynligvis fra annet ekteskap, Martha. Hun var ute på eventyr
med presten Niels Jensen Fris, et eventyr som fikk følger og skaffet presten suspensasjon fra embetet i 1667.